第806回 生医研セミナー(多階層生体防御システム研究拠点)
下記の通り、野島 孝之 先生によるセミナーを開催します。皆様のご来聴を心より歓迎致します。
演題 / Title
RNAプロセシングと共役するゲノム転写制御とその破綻機構
演者 / Speaker
野島 孝之 博士
Takayuki Nojima, PhD
Sir William Dunn School of Pathology, University of Oxford
日時 / Date
2019年11月27日(水) Nov. 27 (Wed), 2019
16:00〜17:00
場所 / Venue
病院キャンパス 生体防御医学研究所 本館1階 会議室
以下の地図の29番です。
(https://www.kyushu-u.ac.jp/f/35767/2019hospital_2.pdf)
Seminar Room, Main Building 1F, Medical Institute of Bioregulation, Hospital Campus
No.29 on the following linked map.
(http://www.kyushu-u.ac.jp/f/35768/2019hospital-en_2.pdf)
要 旨 / Abstract
細胞核内で起こるスプライシングやポリA部位切断といった “RNAプロセシング”は、真核生物のゲノム機能多様性や転写産物安定性に貢献している。重要なことに、骨髄異形成症候群を例とするがん細胞ではRNAプロセシング関連遺伝子の変異が高頻度に検出され、それに伴いRNAプロセシング制御の破綻が見られる。しかしながら、RNAプロセシング制御機構の破綻がどのようにがん細胞増殖に関わっているのか、その多くは未だに明らかにされていない。
試験管内反応を主とした生化学的な解析から、RNAポリメラーゼII (Pol II) 最大サブユニットC末端ドメイン (CTD) のリン酸化がRNAプロセシング効率や正確さを促進することが明らかにされている。我々のグループは、ゲノム転写中のRNAプロセシングを捉えることを可能とする新生RNA解析法の開発を試み、mammalian native elongating transcript sequencing (mNET-seq) 法の確立に成功した1,2。mNET-seq 法はPol II CTDリン酸化状態と共に、Pol II 転写活性部位や転写中のRNA プロセシング中間産物をゲノム上に一塩基解像度でマッピングすることが可能である。また、mNET-seq法プロトコルを質量分析法に適用することで、CTDリン酸化特異的Pol II転写装置とRNAプロセシング装置の複合体解析を可能とした3。これらオミックス転写制御解析アプローチにより、長鎖非コードRNA発現制御機構やその破綻が引き起こすDNA複製ストレス機構も明らかにした4, 5。
本講演では、がん細胞で破綻しているRNAプロセシングと共役するPol II 転写機構をどのように解き明かし、どのようにがん細胞増殖を制圧する手がかりを得られるかを議論したい。
参考論文 / References
- Nojima T, Gomes T. et al.
Mammalian NET-Seq Reveals Genome-wide Nascent Transcription Coupled to RNA Processing.
Cell. 2015 Apr 23;161(3):526-540. - Nojima T, Gomes T. et al.
Mammalian NET-seq analysis defines nascent RNA profiles and associated RNA processing genome-wide.
Nat Protoc. 2016 Mar;11(3):413-28. - Schlackow M, Nojima T. et al.
Distinctive Patterns of Transcription and RNA Processing for Human lincRNAs.
Mol Cell. 2017 Jan 5;65(1):25-38. - Nojima T, Rebelo K. et al.
RNA Polymerase II Phosphorylated on CTD Serine 5 Interacts with the Spliceosome during Co-transcriptional Splicing.
Mol Cell. 2018 Oct 18;72(2):369-379. - Nojima T, Tellier M. et al.
Deregulated Expression of Mammalian lncRNA through Loss of SPT6 Induces R-Loop Formation, Replication Stress, and Cellular Senescence.
Mol Cell. 2018 Dec 20;72(6):970-984.
連絡先 / Contact
生体防御医学研究所
中別府 雄作
092 (642) 6800
Medical Institute of Bioregulation
Yusaku Nakabeppu
TEL: 092 (642) 6800