第840回 生医研セミナー(多階層生体防御システム研究拠点)

以下の通り、下林 俊典 先生によるセミナーを開催します。皆様のご来聴を心より歓迎致します。

※セミナーは日本語で行われます。

演題 / Title

Probing and manipulating genome-templated condensation of transcription factors

演者 / Speaker

下林 俊典 先生 / Shunsuke F. Shimobayashi, Ph.D.
准教授
京都大学 iPS細胞研究所 未来生命科学開拓部門

日時 / Date

2024年1月12日(金) / Jan. 12 (Fri), 2024
17:00〜18:00

以下日程に変更となりました
2024年2月1日(木) / Feb. 1 (Thu), 2024
17:00〜18:00

場所 / Venue

病院キャンパス コラボ・ステーションI 1階 共同セミナー室A・B
キャンパスマップの35番です。

要 旨 / Abstract

As you know, in recent years, liquid-liquid phase separation has been identified as a ubiquitous process in living cells, and is thought to drive the formation of dozens of intracellular structures, which represent condensed forms of biomolecular matter.
However, we are still largely in the dark about when and where the condensates form, despite the critical link to their biological and pathological functions. Here, we demonstrate an optogenetics technology which can spatio-temporally control the condensate formation of transcription factors in nucleus. By analyzing high-throuput data of condensate nucleation, we found that the formation process can be quantitatively interpreted within the framework of classical nucleation theory (CNT), which describes the nucleation process of water droplets from water vapor. Moreover, I would like to show the latest results on how reprogramming factors form condensates while interacting with genome. Our findings illuminate the structure and dynamics of genome-associated transcriptional condensates.

参考文献 / References

  1. Shimobayashi, S.F. et al., biorxiv (2023)
  2. Shimobayashi, S.F. et al., Nature (2021)
  3. M.-T. Wei. et al., Nat cell biol (2020)

連絡先 / Contact

生体防御医学研究所 高深度オミクスサイエンスセンター
遺伝子発現動態学分野
落合 博
092 (642) 6882