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下記のとおり、理化学研究所の藤本先生によるセミナーを開催致します。藤本先生は東大人類遺伝学教室で博士を取得後、理研に移られてからはヒト全ゲノムシークエンスに一貫して携わってこられ、初の日本人検体の個人ゲノムの配列決定を行われた後（業績1）、国際ガンゲノムプロジェクトに参加されました。今回のセミナーでは業績2で報告された、肝細胞癌27例の全ゲノム配列決定の結果を講演頂きます。講演は英語で行われます。奮ってご参加下さい。
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| 演題 | Comprehensive analysis of genetic variation by whole genome sequencing【Seminar in English】
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| 演者 | 藤本 明洋 先生 Dr. Akihiro Fujimoto
理化学研究所 ゲノム医科学研究センター 上級研究員
Center for Genomic Medicine, Riken
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| 日時 | 平成２５年１月２１日（月） Jan. 21 (Mon), 2013
17：00～18：00
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| 場所 | 馬出医学系キャンパス内 コラボ・ステーションⅠ 共同セミナー室A・B
以下の地図の32番になります。
（http://www.kyushu-u.ac.jp/access/map/hospital/hospital.html）
Seminar Room A/B, 1F, Station-I for Collaborative Research
No.32 on the following linked map
（http://www.kyushu-u.ac.jp/access/map/hospital/hospital-e.html）
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| 要旨 |
Whole genome sequence (WGS) is the most effective and straightforward way for understanding the genetic variation in the human genome. We have sequenced and analyzed WGS of a Japanese individual as well as 27 hepatocellular carcinoma (HCC) genomes. In the Japanese genome study, we identified various types of genetic variations, such as ~3 million single nucleotide variants, ~5,000 deletions, and ~3Mbp of novel sequence. In the WGS of HCCs, we observed recurrent mutations in chromatin regulators, the somatic substitution pattern, and hepatitis B virus genome integrations. In this seminar, we will present our analysis methods and discoveries from WGS.
- Fujimoto, A., et al. Whole-genome sequencing and comprehensive variant analysis of a Japanese individual using massively parallel sequencing. Nat Genet 42, 931–936 (2010)
- Fujimoto, A., Totoki, Y., et al. Whole-genome sequencing of liver cancers identifies etiological influences on mutation patterns and recurrent mutations in chromatin regulators. Nat Genet 44,760-764 (2012)
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| 連絡先 | 生体防御医学研究所 ゲノム機能学分野 柴田 弘紀
Division of Human Molecular Genetics, MIB, Hiroki SHIBATA
電話：092-642-6168 |
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