Bisulfite primer pairs

Locus/Amplicon No. Lavel Sense primers (5' to 3') Lavel Antisense primers (5' to 3') Amplicon length
based C57BL/6
(bp)
Annealing
temperature
(℃)
SNPs  
Nespas-Gnasxl A Gnasxl F0 GGGAGTTGAGGAGATGGGTAAAT Gnasxl R0 AAATAACCTCTAATACAAAATTACCCCTAACTAA 664 60 421 T(B6)/A(JF1), 535 CG(B6)/AG(JF1)
Nespas-Gnasxl B Gnasxl F1 GGGGATGTTATTGGTATTTGGTAGGTTTAG Gnasxl R1 CTACCACCTAAATTTTAAACACTAAAAATTAC 671 60 361 A(B6)/G(JF1), 377 ATATA(B6)/GTGTG(JF1)
Nespas-Gnasxl C Gnasxl F3 GTAATTTTTAGTGTTTAAAATTTAGGTGGTAG Gnasxl R3 CACACCTTCACCTATCTAAAACAAAAAATCC 479 60 255 AGA(B6)/-(JF1), 412 TGTT(B6)/-(JF1)
Nespas-Gnasxl D Gnasxl F12 GAAGAATTAGATGGGGAGGGAGG Gnasxl R11 CTATCACCTTCCTAATTACACTTACCCC 449 60 380 A(B6)/T(JF1)
Nespas-Gnasxl E Gnasxl F13 GATTATTTATTTTTATAAAGTTTGGAAATTGAGGTTGGAG Gnasxl R12 CTTCTAAAAATCCACTAATCTCACTACC 383 60 69 -(B6)/T(JF1), 78 TT(B6)/-(JF1)
Gnas 1A A Gnas F1 GTGTGTGTTGTAATGAAGAGAAGTTATAATTAGT Gnas R1 ACCCACAAATACCTTATACCCAAATAAAC 646 60 -  
Gnas 1A B Gnas F2 GTTTATTTGGGTATAAGGTATTTGTGGGT Gnas R2 CCTAAACCTACCTCCCAATTTTCC 635 60 173 CG(B6)/AG(JF1), 293 G(B6)/A(JF1), 322 TTT(B6)/-(JF1)
Gnas 1A C Gnas F6 GGTATTATGTTGAAGATGGTTATGAAGTTTAAAGTT Gnas R6 AACATCATCTTCTTCATCAATATCACTATCC 519 60 324 GAA(B6)/-(JF1)
Gnas 1A D Gnas F7 GGATAGTGATATTGATGAAGAAGATGATGTT Gnas R7 CCCTCCTCCTACAACAACAAAAC 703 60 -  
Peg10 A Peg10 F16 TTGATTAGAATTATATTTTTATGTGATAATTTTGAGG Peg10 R16 CAAATTTTAAAAATCACCCATCTTTCAAAAC 546 60 36 CG(B6)/TT(JF1), 253 T(JF1)/A(B6)
*Peg10 B Peg10 RevF0 GTAAAGGAATAAGGTATTTAAATATTGATTGGG Peg10 RevR0 AACTCTTAAAAAACTCTCAATAAACAACTTAA 651 60 427 A(B6)/G(JF1)
Peg10 C Peg10 F1 GTTTTAAGTTAAGGAAATGTTTGGAGTTGAG Peg10 R1 CTACAAACAACACCCATTACCCTAC 284 60 128 G(B6)/-(JF1), 247 CGTA(B6)/-(JF1)
Peg10 D Peg10 F2 GTAGGGTAATGGGTGTTGTTTGTAG Peg10 R2 TCCCCAAACTTAACCCCTAACC 553 60 123 G(B6)/A(JF1)
Peg10 E Peg10 F7 GTATTTAATTTGGAAAGTTGTAGGAGAG Peg10 R7 CTCCCAACCACCAAATCCCT 603 60 558 -(B6)/GGTGGGAGATGATGGGA(JF1)
Peg10 F Peg10 F18 GTTTTAGAGTTAGTTTATTTGGTTTTTATTTTTAAGG Peg10 R9 AAACTATACAACCAAACTCAAACAAACAAA 251 60 -  
Peg10 G Peg10 F10 TTTGTTTGTTTGAGTTTGGTTGTATAGTTT Peg10 R10 CAACTCAACTCAAAACAACAAAACTCC 702 60 78 G(B6)/A(JF1), 494 -(B6)/T(JF1), 634 G(B6)/A(JF1)
Peg10 H Peg10 F14 AGTGGTGAAGGTTATAGATTTTTAATTGGTGAT Peg10 R15 ACAACCTAACTCAAATCAAAAAAATACATACCCT 338 60 -  
Peg1/Mest A Peg1 F15 GGTAGGTAGAGGGTTTAGGTTGTTGG Peg1 R15 TCATTTACTACTCACCACAAACCCTCT 348 60 297 A(B6)/G(JF1)
Peg1/Mest B Peg1 F16 TGAGTGGTTAAGATGGTTTTTATTTGTGGA Peg1 R16 CAAAATCAATACTACACAAACTATTCCCTACCT 445 60 192 T(B6)/-(JF1), 306 T(B6)/A(JF1)
Peg1/Mest C Peg1 F17 AGGTAGGGAATAGTTTGTGTAGTATTGATTTTG Peg1 R17 CCAACAACTAAACCCTCTTACTCCT 533 60 142 TT(B6)/-(JF1), 493 A(B6)/G(JF1)
Peg1/Mest D Peg1 F13 AGGAGTAAGAGGGTTTAGTTGTTGGT Peg1 R13 ACCCATTTTAAACACTATAACAAATTAAACAAACCC 623 60 160 TGTGTATGTGTGTGTGTGTG(B6)/-(JF1),
329 TT(B6)/CG(JF1), 446 TTT(B6)/-(JF1)
Peg1/Mest E Peg1 F1 AGTAGAGTATTTTTAGTGTTGTTTGAGGAGT Peg1 R1 ACCTTCACATCCTTCTATACCATAATTCAC 478 60 136 TTTT(B6)/-(JF1)
Peg1/Mest F Peg1 F2 GTGAATTATGGTATAGAAGGATGTGAAGGT Peg1 R2 CTCTCAACCACAAAAACAATTCCAATCCAA 503 60 299 T(B6)/-(JF1)
Peg1/Mest G Peg1 F8 GAGGTGGTGGTGAAGTAATTTAGG Peg1 R8 CCCAACCATTCTCAACTTTAATTACCTTA 627 60 110 CG(B6)/TA(JF1), 540 G(B6)/T(JF1)
Peg1/Mest H Peg1 F9 TAAGGTAATTAAAGTTGAGAATGGTTGGG Peg1 R9 CCCCTTAAAAACCTCAACTACCTACC 531 60 328 A(B6)/G(JF1)
Peg1/Mest I Peg1 F10 GGTAGGTAGTTGAGGTTTTTAAGGGG Peg1 R10 CCCAACTTACCATACCTAAATTTCAAAAATCC 342 60 63 ATATTTTTTTTATATATAT(B6)/GTATTTTTTTTTATATATATATAA(JF1),
149 AT(B6)/-(JF1), 256 A(B6)/T(JF1), 275 CG(B6)/TT(JF1)
Peg1/Mest J Peg1 F12 TGATTTTTGGAAGTGTATAATGTTATTTTGGTTGGT Peg1 R12 AAATACTATATAACTTACCTAACACTAAAAAC 415 60 256 A(B6)/G(JF1)
Peg1/Mest K Peg1 F14 GTTTTTAGTGTTAGGTAAGTTATATAGTATTT Peg1 R14 TCAAATTATTCAAACAATAAAATACCTTACCAACAATACT 622 60 475 G(B6)/A(JF1)
Peg3 A Peg3 F0 GTTTGATGTTGTTTTAAGATATTGAGAGGTAT Peg3 R0 TCTTACACAACCTCTCCCTAAATAACC 665 60 350 AAAAGG(B6)/-(JF1), 377 T(B6)/G(JF1), 423 T(B6)/G(JF1),
462 -(B6)/AAGTTAGTGTTTTACGTATGTTAGGTAAGTATTGTAGTAAAT
GAATTATAGTTATTTTAGTTATTTAATATTTTG(JF1), 468 G(B6)/ A(JF1)
Peg3 B Peg3 F1 GGTGGTTATTTAGGGAGAGGTTGTG Peg3 R1 CTTAAATCTTTAACTATTCATTCTACTCCCC 637 60 536 -(B6)/T(JF1)
Peg3 C Peg3 F2 GGGGAGTAGAATGAATAGTTAAAGATTTAAG Peg3 R2 CTTTATTCTCTATACCCATAAATTTCCTTAAC 635 60 52 CGCG(B6)/TAAG(JF1), 89 A(B6)/G(JF1), 193 AGTAAGTAAGTA(B6)/-(JF1), 349 -(B6)/A(JF1), 362 CG(B6)/TA(JF1)
Peg3 D Peg3 F3 GTTAAGGAAATTTATGGGTATAGAGAATAAAG Peg3 R12 CTAAAAAAATCTTAACCTAACTATCTACATAA 509 60 192 -(B6)/AA(JF1)
Peg3 E Peg3 F8 GGTGAAGAAGGGAGTGGTAGG Peg3 R8 CCTTCAATAATCACTTCAAACACACC 456 60 343 -(B6)/G(JF1)
Peg3 F Peg3 F9 GGGGTAAGTTTTAGGAAGGGG Peg3 R9 CCCTACCCCTACAACCAACCC 559 60 107 A(B6)/G(JF1)
Peg3 G Peg3 F10 GGGTTGGTTGTAGGGGTAGGGT Peg3 R10 CCACACCCCTTTCCCAAAATTCTA 628 60 198 A(B6)/G(JF1)
Peg3 H Peg3 F11 TGAGAAAAGAAGTATTTTTATGGAGTATTATGGGAG Peg3 R11 ACCTACCCTACCCTCTACACCT 482 60 178 -(B6)/ATTG(JF1)
Snrpn DMR1 A Snrpn F0 GAGAAGGTGGGGTGGATTATTAGT Snrpn R0 ATATCTTTACCCCTCCTTTCCTACAATATC 666 60 46 A(B6)/G(JF1), 125 G(B6)/A(JF1), 179 A(B6)/-(JF1),
274 A(B6)/G(JF1), 300 T(B6)/-(JF1), 394 TT(B6)/CG(JF1),
452 -(B6)/GGGAATTATTTGTTTTGTTATA(JF1), 454 G(B6)/A(JF1),
592 -(B6)/ATTGTGAAAAG(JF1)
Snrpn DMR1 B Snrpn F1 GATATTGTAGGAAAGGAGGGGTAAAGATAT Snrpn R1 CTATACAATACTTACTTTTACCCACTCATTAAA 510 60 103 A(B6)/G(JF1), 348 G(B6)/T(JF1)
Snrpn DMR1 C Snrpn F2 TTTAATGAGTGGGTAAAAGTAAGTATTGTATAG Snrpn R2 ACTTCTAATTTAAAACCTTAAAACTCTAACCCATA 435 60 174 G(B6)/A(JF1)
Snrpn DMR1 D Snrpn F10 GTTTTGGTTAAATAGGATGTATTTTTATTATTAG Snrpn R10 AACAATTATATCCATTATTCCAAATTAACAATA 378 60 234 T(B6)/A(JF1), 290 G(B6)/A(JF1), 301 G(B6)/A(JF1), 322 A(B6)/T(JF1)
Snrpn DMR1 E Snrpn F6 GAGGGTTTGTAAGAATTGTTAATGAGGTATTT Snrpn R6 CCAACCCAACCATAACACATCCTAT 620 60 43 G(B6)/-(JF1), 68 CGTA(B6)/TTTA(JF1), 90 CGTA(B6)/TATG(JF1), 314 -(B6)/GT(JF1), 428 AATAAGTT(B6)/-(JF1), 468 T(B6)/G(JF1)
Snrpn DMR1 F Snrpn F7 GAGAGGGTATTTTGTAAGTTTGGGTT Snrpn R7 TCAAACTTACATAAATAAACCTACCTCACTTAA 505 60 54 -(B6)/AGATGGTTGTTTT(JF1), 214 T(B6)/G(JF1), 351 CG(B6)/TA(JF1) 429 A(B6)/T(JF1)
Snrpn DMR1 G Snrpn F8 AGTTTGGTTTATAATATGAGTTTTAGGATAGTTAGGATT Snrpn R8 CCTCACTATATTTTTAAAAATCTTTCAAAACTATAACCACAA 632 60 97 G(B6)/A(JF1), 170 CG(B6)/TT(JF1), 207 A(B6)/T(JF1), 251 A(B6)/G(JF1), 358 T(B6)/A(JF1), 553 A(B6)/G(JF1)
Snrpn DMR1 H Snrpn F9 GTGTATTAGGGGTATGTTTTTTGTTTTTAGAGGT Snrpn R9 CCCCAACTCAAACTAAACCCTATACCC 466 60 44 G(B6)/A(JF1), 155 CG(B6)/TA(JF1), 304 A(B6)/-(JF1), 410 A(B6)/G(JF1)
Lit1/Kcnq1ot1 A Lit1 F7 GGAGGTTTTATTGATATGTGGTGTTATTTTGATT Lit1 R7 AAACAAATTTTTAAAACCCCACATTTCTTTATAACAATAATA 471 60 279 -(B6)/TATTT(JF1), -(B6)/AAATAAATTATA(JF1)
Lit1/Kcnq1ot1 B Lit1 F8 AGATTTTTTTAGGAAAGGTTATAGATGGTTTGAGG Lit1 R8 ACAAACCAAAAATATTTTCCTAACCACCTCC 394 60 113 T(B6)/A(JF1), 125 A(B6)/T(JF1)
Lit1/Kcnq1ot1 C Lit1 F0 GGTGGTTAGGAAAATATTTTTGGTTTGT Lit1 R0 AAATAATCCATTTCTACACCTATTTTCCAAATAC 620 60 -  
Lit1/Kcnq1ot1 D Lit1 F1 GTTGGGTGGGGTAAGTTTTAGGG Lit1 R1 ACCTCCAACCATAAAATTAATTTCATTACTACCTC 785 60 279 A(B6)/T(JF1), 330 -(B6)/G(JF1), 415 A(B6)/G(JF1)
Lit1/Kcnq1ot1 E Lit1 F6 GTTGGGAAGGATTATGTAGAGAAAAGTATATT Lit1 R6 CCAAAACCAAAAACATACTCATCTTTAACC 589 60 167 CG(B6)/TA(JF1)
Lit1/Kcnq1ot1 F Lit1 F5 GTATTTGGATTGGGTGAGTTTGTATAGGAT Lit1 R5 CTCCCCTTCCCCTAAATCCTATTTAAAATC 726 60 -  
Zac1 A Zac1 F5 AGTGTTTAATTTGAGAATTGATAGTAGAGTTAAGATGT Zac1 R5 CCTACCCCCATCCCACATATAACATA 555 60 196 T(B6)/G(JF1), 235 G(B6)/A(JF1), 366 TG(B6)/CG(JF1), 370 CG(B6)/TT(JF1)
Zac1 B Zac1 F0 GGGGTTGGGAGAGTAGGTTG Zac1 R0 ACACTCTTTCTCCTATCCTAACCCAAA 607 60 53 CG(B6)/TA(JF1), 116-(B6)/GT(JF1), 264 TTTTTTTTTTT(B6)/-(JF1), 317 G(B6)/A(JF1), 504 CG(B6)/TA(JF1)
Zac1 C Zac1 F1 TTTGGGTTAGGATAGGAGAAAGAGTGT Zac1 R1 CCATCCCCACAAAAATAATCCACCC 517 60 65 CG(B6)/TA(JF1), 176 AG(B6)/CG(JF1), 286 -(B6)/TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT(JF1)
Zac1 D Zac1 F4 TTGGGTTGGAGTTTGTGTTTGTTTTTTTGG Zac1 R4 CATTTCTTCCCCTCAACACTAAAAAAAATCTATAC 679 60 370 TTTTTTT(B6)/-(JF1), 513 TA(B6)/CG(JF1)
Zac1 E Zac1 F6 AGAATTTGGTAGGTAAGGTTATTGTTTAGGG Zac1 R6 AACTAAATAAAATATATCCAACCAACACCAAAATTACTT 549 60 250 A(B6)/G(JF1)
Meg1/Grb10 A Meg1 F1 GGTGAAAGAAGAGGATTTATATTGTTTGG Meg1 R1 ACTTCTTACCACTCCCCATATCTAAAC 727 60 -  
Meg1/Grb10 B Meg1 F2 TTGATGGATATGAGGGGTTAAAAGG Meg1 R2 TTAACTACCCTTCTCATCAACTACC 466 60 99 TTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAA(B6)/ AATAATTTTTTTTTTAAAAAAAAT(JF1), 151 AAAAAATAAAAAAT(B6)/-(JF1)
*Meg1/Grb10 C Meg1 RevF5 TTTGTAATGGTTTAAGTGGTGGGTAGTTT Meg1 RevR5 ACAATCAAAATATAAACAAATAATCTAACTACTTCTCTAAAAATCT 677 60 105 CG(B6)/TA(JF1), 172 CG(B6)/TA(JF1)
Meg1/Grb10 D Meg1 F3 TGTTGGGAAGTTTGTTTTGTTGAGT Meg1 R3 TCACTCAAAACTCCCCTCCTC 441 60 -  
Meg1/Grb10 E Meg1 F4 GAAAAAGTTTGAGTATGGTTAAGAGAAAAGT Meg1 R4 CCACCCTAAAACCTCTACTCCC 521 60 133 -(B6)/TATA(JF1), 456 CG(B6)/TA(JF1)
Meg1/Grb10 F Meg1 F6 AGTATAGTTAGTTTAAGGAGAGAAAATTTGGGTTT Meg1 R6 CACAAAATCTCAAATTTCATCCCTAATTTCCA 431 60 110 G(B6)/T(JF1), 119 A(B6)/G(JF1), 237 AAAAA(B6)/-(JF1), 250 A(B6)/G(JF1)
U2af1-rs1 A U2af1-rs1 F2 AAAGATTTTTTAGTTGAGTGATAGTATTGTAGTTTT U2af1-rs1 R2 TCTCAACTCTTCCTACACCATACCTA 656 60 -  
U2af1-rs1 B U2af1-rs1 F6 GTTTGTGTAAGTATAAGAGTTTATGGGGAT U2af1-rs1 R6 TCCTACAATAAAAATACTCAACCCTAAACC 679 60 128 -(B6)/TAAA(JF1), 276 TA(B6)/-(JF1), 419 TA(B6)/CG(JF1), 621 G(B6)/A(JF1), 649 CG(B6)/AG(JF1)
U2af1-rs1 C U2af1-rs1 F4 GATTATATGAAGAGTGGTTGTTGAGGG U2af1-rs1 R4 TCATAATCATCCCTTCTACACTACTCC 436 60 196 CG(B6)/TA(JF1)
U2af1-rs1 D U2af1-rs1 F7 GGAATGGAGTAGTGTAGAAGGGATGATTATGAT U2af1-rs1 R7 ACCAAAATAATAACTTCTTAACTTACTATAATATTCCTCATA 522 60 -  
U2af1-rs1 E U2af1-rs1 F5 GAGGAATATTATAGTAAGTTAAGAAGTTATTATTTTGGTTT U2af1-rs1 R5 ACAAATTCCAAACCAACCAAAAATACATAA 712 60 418 GAA(B6)/TAGAG(JF1), 572 G(B6)/A(JF1)
Igf2r DMR2 A Igf2r DMR2 F7 TGGTGGTTTTGGGTGGTAGTGA Igf2r DMR2 R7 AATTATCTACTCTCCCTTTAAAAAAACAACCCTA 414 60 126 TGTTTTT(B6)/AT8JF1), 285 G(B6)/T(JF1)
Igf2r DMR2 B Igf2r DMR2 F8 GGTGGTTAGGAAAATTTTTATAGGAGTGGT Igf2r DMR2 R8 ACCCTCATCTACAAAATCCTCCCC 545 60 336 -(B6)/G(JF1)
Igf2r DMR2 C Igf2r DMR2 F4 GGGGAATTGAGGTAAGTTAGGGTTTT Igf2r DMR2 R4 TCTTATAACCCAAAAATCTTCACCCTAAC 271 60 87 A(B6)/G(JF1)
Igf2r DMR2 D gf2r DMR2 F9 GAAGGGTTTTGTGATTAGGGTTAA Igf2r DMR2 R9 AACACCTTCATATACCCCTAAACAC 286 60 51 A(B6)/G(JF1)
Igf2r DMR2 E Igf2r DMR2 F5 TGTGTTTAGGGGTATATGAAGGTGTT Igf2r DMR2 R5 TCCCAAAATATACCAACCAATACAACAA 616 60 82 T(B6)/A(JF1), 424 CGG(B6)/TCG(JF1)
Igf2r DMR2 F Igf2r DMR2 F2 AGTTAGAGTTATTAGAGAAGGAGGAGATTT Igf2r DMR2 R2 AACTACCATAATATATACTAAACCCAAAACCAA 711 60 455 TA(B6)/CG(JF1)
Igf2r DMR2 G Igf2r DMR2 F3 TTGGTTTTGGGTTTAGTATATATTATGGTAGTT Igf2r DMR2 R3 AACTATCCTTAACTCTCTTTATAATATCTCAATCTTAAA 698 60 150 -(B6)/T(JF1), 185 TA(B6)/CG(JF1), 394 G(B6)/-(JF1), 509 G(B6)/A(JF1)
Impact A Impact F1 TTTTATGGTATTGGTATAGAGATAGGTAGGT Impact R1 ACCTCCTTCCATATCTTATAAACATTCAAAA 598 60 521 CG(B6)/TA(JF1)
Impact B Impact F2 TTTTGAATGTTTATAAGATATGGAAGGAGGT Impact R2 AAACTCTCATACTCATCCTTCAAAACAA 403 60 145 -(B6)/-(JF1), 242 T(B6)/A(JF1), 261 TA(B6)/CG(JF1)
Impact C Impact F4 TGTTTTGAAGGATGAGTATGAGAGTTTT Impact R4 CCCTACTAAAACCTTACCTACCTCTAAC 405 60 38 -(B6)/TGTTGTA(JF1)
Impact D Impact F3 GTGGTATAGATGGGTAGGGTTAG Impact R3 CATCTTAATTTCCCCACCTTTCCAA 675 60 250 A(B6)/G(JF1), 338 TAGAATAAATATATTA(B6)/-(JF1)
H19 A H19 F13 AGTGGGTGGATAATTAGGTGGTTGA H19 R13 ACAAACACACCATTCCCATAAAACACTAC 619 60 -  
H19 B H19 F12 GAATGGTGTGTTTGTAGGTTGGAT H19 R12 AACAAATAAATCTCCTTCTTCTCTCTTAACCTC 611 60 -  
H19 C H19 F9 GAGGTTAAGAGAGAAGAAGGAGATTTATTTGTT H19 R9 CAACTTCAATATAACAAAATACCTAAAACACCACC 752 62 367 CG(B6)/TA(JF1)
H19 D H19 F8 AATGGGAATTTGAGGGTATGGGTTTT H19 R8 ACCCTTAAATCCTCCTCCCATCTAAAAC 490 60 386 TA(B6)/CG(JF1)
H19 E H19 F11 GTTATTGTTGTGGGTGGATTTTAAGTTATGATATTG H19 R11 ACCACACCAATAAATAACTTACATATAATAACCAACC 289 60 139 G(B6)/A(JF1)
*H19 F H19 RevF2 TTTAGTTTGAAGTGAAGTAGGAGGGT H19 RevR2 CCCTAACAACATCAACAAACTAAAAACC 586 LA Taq 465 G(B6)/A(JF1)
H19 G H19 F7 AATGGTTGAATTTTAGTTTTTGTTTTTATGGTT H19 R7 ACCAATACAATCCCACATACTTTATCATAAAA 506 60 89 CG(B6)/TT(JF1), 148 A(B6)/-(JF1)
H19 H H19 F5 TGATTTTTTTGAGGTATTGAATTTGGGTGATT H19 R5 ACTTTCTACCCTAACAATCCCCAAATTAAC 670 60 63 TA(B6)/CG(JF1), 271 CG(B6)/AG(JF1), 526 A(B6)/T(JF1)
H19 I H19 F14 GGTAGAAAGTATAATGAGGGTAGTAAGTTTTGG H19 R14 TCCTAAAACTCACTTTATAAACCAAACTAACCTC 648 62 225 GTG(B6)/-(JF1), 265 G(B6)/A(JF1)
Rasgrf1 A Rasgrf1 F17 AGGTAGGAGTATTAGTTGTGTTTGGGT Rasgrf1 R14 CCCAATTATCATCAATTAAAAAATCATTAATCTAAAAACCAAAC 590 60 348 TA(B6)/CG(JF1)
Rasgrf1 B Rasgrf1 F8 TGGTTTTTAGATTAATGATTTTTTAATTGATGATAATTGGGT Rasgrf1 R8 ATTCTATCCTTTAAAATAACCAATAAAAACACAATACACT 653 60 451 A(B6)/G(JF1), 565 -(B6)/AAA(JF1)
Rasgrf1 C Rasgrf1 F9 AGTGTATTGTGTTTTTATTGGTTATTTTAAAGGATAGAAT Rasgrf1 R9 AAACCATCACAAAAAACCACACAACTC 416 60 -  
Rasgrf1 D Rasgrf1 F6 GAGTTGTGTGGTTTTTTGTGATGGTTT Rasgrf1 R6 TCCCTAATAACCAAAAAAAAACATTTTAAATCCCC 744 60 454 T(B6)/G(JF1), 558 A(B6)/T(JF1), 619 A(B6)/G(JF1)
Rasgrf1 E Rasgrf1 F0 GGGATTTAAAATGTTTTTTTTTGGTTATTAGGGAT Rasgrf1 R0 ACATTCTCAACAAAAACAATAACCTACCTA 659 60 72 AAAAAAAAAAAA(B6)/-(JF1)
Rasgrf1 F Rasgrf1 F1 TGTTTTTGTTGAGAATGTATGTGTTTAAGAGAGT Rasgrf1 R1 ACCCAACTCTACATAAACCAAACAAAATAATACC 648 60 303 G(B6)/A(JF1), 403 G(B6)/A(JF1)
Rasgrf1 G Rasgrf1 F2 GGTATTATTTTGTTTGGTTTATGTAGAGTTGGGT Rasgrf1 R2 AACTTTATAAACTCTCTAAAAAATCCCCAAAATTCC 492 60 365 TT(B6)/CG(JF1), 395 A(B6)/G(JF1)
Rasgrf1 H Rasgrf1 F19 GGAATTTTGGGGATTTTTTAGAGAGTTTATAAAGT Rasgrf1 R19 CAAAAACAACAATAATAACAAAAACAAAAACAATAT 400 60 106 TA(B6)/CG(JF1), 114 CG(B6)/TA(JF1), 141 ATCGTTGTCGTTAAGT(B6)/-(JF1), 158 A(B6)/G(JF1), 243 -(B6)/TAATTAGTTTGATTACGATTATTGCGTTA(JF1), 320 -(B6)/TT(JF1), 360 G(B6)/A(JF1)
Rasgrf1 I Rasgrf1 F3 TTGTTGTTTTTGTTTTATATTGTTTTTGTTTTAGATATTATTGTTG Rasgrf1 R3 CAAATCTAATCTTCCTCATCAAAATATCTCCAACTA 439 60 136 A(B6)/T(JF1), 394 ATGTTAACG(B6)/AAG(JF1)
Rasgrf1 J Rasgrf1 F4 TAGTTGGAGATATTTTGATGAGGAAGATTAGATTTG Rasgrf1 R4 AACCATCCTAATTAACAAAACAAAACCC 607 60 44 A(B6)/G(JF1)、389 G(B6)/A(JF1), 549 TTTT(B6)/-(JF1)
Rasgrf1 K Rasgrf1 F7 TTTTTGTTTGTTTTTAGTATGTTAAGATTGTAAATGTGAATT Rasgrf1 R7 TTCCCAACCACATATAAATTCACATACCTT 736 60 628 A(B6)/T(JF1)
Rasgrf1 L Rasgrf1 F10 AAGGTATGTGAATTTATATGTGGTTGGGAA Rasgrf1 R10 TCCATTCCTCCCTCCAAAAAAACAC 644 60 263 G(B6)/A(JF1)
Rasgrf1 M Rasgrf1 F11 AAATTTGAATTTGGAATATTTATTAGTTTGGGGGA Rasgrf1 R11 ACCCTAAAAACAAAACAAATCAAAAACTCTCT 475 60 285 -(B6)/TTTTTTTTTTTTTTTTG(JF1)
Rasgrf1 N Rasgrf1 F15 TGGGAGGAAGGATTGTGTATATATGGAT Rasgrf1 R15 ACTTCCAAAACACTCTCTCTACTTTCTCTA 636 60 212 TA(B6)/CG(JF1), 402 CG(B6)/GG(JF1), 574 G(B6)/T(JF1)
IG-DMR A IG-DMR F2 AGGGAATAGGATGTATTATGGAGTAATGT IG-DMR R2 AAACACCTAACCTATATTACAATACATCCATA 502 60 170 -(B6)/AT(JF1), 208 A(B6)/G(JF1), 226 TATG(B6)/-(JF1), 380 TA(B6)/CG(JF1)
IG-DMR B IG-DMR F5 ATATGGATGTATTGTAATATAGGTTAGGTGTT IG-DMR R5 AATACACCATAACATAAACATAAAAATCCACAA 418 60 74 A(B6)/G(JF1), 77 CG(B6)/G(JF1)
IG-DMR C IG-DMR F6 GTGTTGTAATTAGTTATAGTGGAGAGTATGTT IG-DMR R6 TCCCCCCACCAAAAACTAACC 428 60 125 CG(B6)/AG(JF1), 230 TTTTT(B6)/-(JF1)
IG-DMR D IG-DMR F7 TTATTATTTTGTGGTTATTTTTATTTAGAGAAAGTTTTATTGTTGT IG-DMR R7 TCCTTAAAACCCTCAAAAAACCAAATTATAATCTC 640 60 345 -(B6)/GG(JF1), 360 T(B6)/A(JF1), 461 -(B6)/TATATATATATATATATATATATATATATATA(JF1)
IG-DMR E IG-DMR F4 AGGAAGGGTAGTAGGGAATTTGTT IG-DMR R4 ATCCAACCCAACCAAATCCATAAAC 364 60 -  

105 pairs
*designed primers on the anti-sense